MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 plasmid pET44827

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010813	GCGCC	2	10	18	27	0 %	0 %	40 %	60 %	189458506
2	NC_010813	CCG	2	6	54	59	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458506
3	NC_010813	ACG	2	6	68	73	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458506
4	NC_010813	CGT	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458506
5	NC_010813	TCA	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458506
6	NC_010813	TCA	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458506
7	NC_010813	GAC	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458506
8	NC_010813	AAG	2	6	296	301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458506
9	NC_010813	CGA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458506
10	NC_010813	GC	3	6	322	327	0 %	0 %	50 %	50 %	189458506
11	NC_010813	TCC	2	6	359	364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189458506
12	NC_010813	CCA	2	6	452	457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458506
13	NC_010813	GCA	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458506
14	NC_010813	CTGG	2	8	705	712	0 %	25 %	50 %	25 %	189458506
15	NC_010813	AAC	2	6	718	723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189458506
16	NC_010813	CCA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458506
17	NC_010813	TAGC	2	8	800	807	25 %	25 %	25 %	25 %	189458506
18	NC_010813	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458506
19	NC_010813	CCA	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458507
20	NC_010813	CGC	2	6	1775	1780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458507
21	NC_010813	CGC	2	6	1851	1856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458507
22	NC_010813	GGC	2	6	1962	1967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458507
23	NC_010813	GAC	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458508
24	NC_010813	AATC	2	8	2066	2073	50 %	25 %	0 %	25 %	189458508
25	NC_010813	TAC	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458508
26	NC_010813	CTGCCC	2	12	2101	2112	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	189458508
27	NC_010813	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458508
28	NC_010813	ACC	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458508
29	NC_010813	GCT	2	6	2182	2187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458508
30	NC_010813	GCG	2	6	2208	2213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458508
31	NC_010813	GGC	2	6	2247	2252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458508
32	NC_010813	ACG	3	9	2331	2339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458508
33	NC_010813	CTG	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458508
34	NC_010813	GTTG	2	8	2534	2541	0 %	50 %	50 %	0 %	189458508
35	NC_010813	AAG	2	6	2542	2547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458508
36	NC_010813	TGCG	2	8	2646	2653	0 %	25 %	50 %	25 %	189458508
37	NC_010813	GCC	2	6	2782	2787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458508
38	NC_010813	GGT	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189458508
39	NC_010813	ACA	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189458508
40	NC_010813	CGT	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458509
41	NC_010813	GCCC	2	8	2974	2981	0 %	0 %	25 %	75 %	189458509
42	NC_010813	CAG	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458509
43	NC_010813	GCG	2	6	3087	3092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458509
44	NC_010813	GTT	2	6	3218	3223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458509
45	NC_010813	C	6	6	3234	3239	0 %	0 %	0 %	100 %	189458509
46	NC_010813	GAG	2	6	3317	3322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189458509
47	NC_010813	GCTC	2	8	3458	3465	0 %	25 %	25 %	50 %	189458509
48	NC_010813	GCCC	2	8	3517	3524	0 %	0 %	25 %	75 %	189458509
49	NC_010813	GCA	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458509
50	NC_010813	CA	3	6	3539	3544	50 %	0 %	0 %	50 %	189458509
51	NC_010813	GCC	2	6	3547	3552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458509
52	NC_010813	CGA	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458509
53	NC_010813	CG	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	189458509
54	NC_010813	TCCT	2	8	6563	6570	0 %	50 %	0 %	50 %	189458510
55	NC_010813	TC	3	6	6586	6591	0 %	50 %	0 %	50 %	189458510
56	NC_010813	CTA	2	6	6626	6631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458510
57	NC_010813	TCTTT	2	10	7084	7093	0 %	80 %	0 %	20 %	189458511
58	NC_010813	GCT	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458512
59	NC_010813	T	6	6	8119	8124	0 %	100 %	0 %	0 %	189458512
60	NC_010813	ACG	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458512
61	NC_010813	GCT	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458512
62	NC_010813	GCTC	2	8	8312	8319	0 %	25 %	25 %	50 %	189458512
63	NC_010813	CG	3	6	8359	8364	0 %	0 %	50 %	50 %	189458512
64	NC_010813	TCA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458512
65	NC_010813	GGCGA	2	10	8473	8482	20 %	0 %	60 %	20 %	189458512
66	NC_010813	CGA	2	6	8488	8493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458512
67	NC_010813	GAC	2	6	8494	8499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458512
68	NC_010813	ATCTT	2	10	8573	8582	20 %	60 %	0 %	20 %	189458512
69	NC_010813	AGT	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189458512
70	NC_010813	ATT	2	6	8635	8640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189458512
71	NC_010813	GCA	2	6	8734	8739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458513
72	NC_010813	AGCA	2	8	8826	8833	50 %	0 %	25 %	25 %	189458513
73	NC_010813	CTG	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458513
74	NC_010813	CGA	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458513
75	NC_010813	CCA	2	6	8878	8883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458513
76	NC_010813	TGT	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458514
77	NC_010813	GGA	2	6	10953	10958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189458514
78	NC_010813	A	6	6	11068	11073	100 %	0 %	0 %	0 %	189458514
79	NC_010813	CCAAA	2	10	11099	11108	60 %	0 %	0 %	40 %	189458514
80	NC_010813	CAC	2	6	11183	11188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458514
81	NC_010813	GCA	2	6	11301	11306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458514
82	NC_010813	CAG	2	6	11408	11413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458514
83	NC_010813	TCC	2	6	11656	11661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189458515
84	NC_010813	GAA	2	6	11703	11708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458515
85	NC_010813	G	7	7	11819	11825	0 %	0 %	100 %	0 %	189458515
86	NC_010813	TTGG	2	8	11875	11882	0 %	50 %	50 %	0 %	189458515
87	NC_010813	ATTG	2	8	11929	11936	25 %	50 %	25 %	0 %	189458515
88	NC_010813	ACC	2	6	11990	11995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458515
89	NC_010813	ACG	2	6	12092	12097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458515
90	NC_010813	A	6	6	12122	12127	100 %	0 %	0 %	0 %	189458515
91	NC_010813	TCA	2	6	12294	12299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458515
92	NC_010813	AGA	2	6	12313	12318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458516
93	NC_010813	GA	3	6	12338	12343	50 %	0 %	50 %	0 %	189458516
94	NC_010813	CT	3	6	12422	12427	0 %	50 %	0 %	50 %	189458516
95	NC_010813	CTA	2	6	12456	12461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458516
96	NC_010813	GTG	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189458516
97	NC_010813	CCAC	2	8	12545	12552	25 %	0 %	0 %	75 %	189458516
98	NC_010813	GAA	2	6	12615	12620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458516
99	NC_010813	CTG	2	6	12750	12755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458516
100	NC_010813	ATT	2	6	12797	12802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189458516
101	NC_010813	CTGTG	2	10	12856	12865	0 %	40 %	40 %	20 %	189458516
102	NC_010813	AG	3	6	12891	12896	50 %	0 %	50 %	0 %	189458516
103	NC_010813	GGC	2	6	12904	12909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458516
104	NC_010813	TCC	2	6	12925	12930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189458516
105	NC_010813	GAT	2	6	13006	13011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189458516
106	NC_010813	GGAA	2	8	13025	13032	50 %	0 %	50 %	0 %	189458516
107	NC_010813	GAA	2	6	13107	13112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458516
108	NC_010813	TTC	2	6	13228	13233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458517
109	NC_010813	GAA	2	6	13248	13253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189458517
110	NC_010813	GC	3	6	13357	13362	0 %	0 %	50 %	50 %	189458517
111	NC_010813	TTGCC	2	10	13379	13388	0 %	40 %	20 %	40 %	189458517
112	NC_010813	GA	3	6	13416	13421	50 %	0 %	50 %	0 %	189458517
113	NC_010813	CCA	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189458517
114	NC_010813	TCG	2	6	13447	13452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458517
115	NC_010813	TCC	2	6	13494	13499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189458517
116	NC_010813	TG	4	8	13517	13524	0 %	50 %	50 %	0 %	189458517
117	NC_010813	CTT	2	6	13683	13688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458517
118	NC_010813	ACA	2	6	13702	13707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189458517
119	NC_010813	CTG	2	6	13790	13795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458517
120	NC_010813	TGT	2	6	13848	13853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458517
121	NC_010813	AAC	2	6	13998	14003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189458517
122	NC_010813	GA	3	6	14074	14079	50 %	0 %	50 %	0 %	189458517
123	NC_010813	TCG	2	6	14134	14139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458517
124	NC_010813	GGC	2	6	14465	14470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458518
125	NC_010813	TCGA	2	8	14501	14508	25 %	25 %	25 %	25 %	189458518
126	NC_010813	AGT	2	6	14534	14539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189458518
127	NC_010813	CTGG	2	8	14595	14602	0 %	25 %	50 %	25 %	189458518
128	NC_010813	CCG	2	6	14743	14748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458518
129	NC_010813	GTC	2	6	14761	14766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458518
130	NC_010813	TGAAT	2	10	14779	14788	40 %	40 %	20 %	0 %	189458518
131	NC_010813	TGT	2	6	14859	14864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458518
132	NC_010813	TGC	2	6	14941	14946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458518
133	NC_010813	TCG	2	6	15035	15040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458518
134	NC_010813	TTC	2	6	15055	15060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458518
135	NC_010813	CCG	2	6	15149	15154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458518
136	NC_010813	CG	3	6	15220	15225	0 %	0 %	50 %	50 %	189458518
137	NC_010813	CAT	2	6	15340	15345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458518
138	NC_010813	CCG	2	6	15362	15367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189458518
139	NC_010813	CG	3	6	15388	15393	0 %	0 %	50 %	50 %	189458518
140	NC_010813	ACG	2	6	15563	15568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458518
141	NC_010813	CAT	2	6	15580	15585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189458518
142	NC_010813	TGA	2	6	15618	15623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189458518
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144	NC_010813	GTT	2	6	15678	15683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458518
145	NC_010813	CCAG	2	8	15698	15705	25 %	0 %	25 %	50 %	189458518
146	NC_010813	TAG	2	6	15710	15715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189458518
147	NC_010813	GAAG	2	8	15773	15780	50 %	0 %	50 %	0 %	189458518
148	NC_010813	TTC	2	6	15895	15900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458518
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152	NC_010813	TTC	2	6	16084	16089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458518
153	NC_010813	GAAT	2	8	16242	16249	50 %	25 %	25 %	0 %	189458518
154	NC_010813	CACG	2	8	16284	16291	25 %	0 %	25 %	50 %	189458518
155	NC_010813	TTC	2	6	16292	16297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458518
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157	NC_010813	GTT	2	6	16360	16365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458518
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159	NC_010813	TGTGG	2	10	16598	16607	0 %	40 %	60 %	0 %	189458518
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162	NC_010813	CTTT	2	8	16820	16827	0 %	75 %	0 %	25 %	189458518
163	NC_010813	CCAT	2	8	16856	16863	25 %	25 %	0 %	50 %	189458518
164	NC_010813	GAG	2	6	16913	16918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189458518
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167	NC_010813	GTG	2	6	16981	16986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189458518
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171	NC_010813	GAG	2	6	17306	17311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189458518
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173	NC_010813	TC	3	6	17439	17444	0 %	50 %	0 %	50 %	189458518
174	NC_010813	A	6	6	17451	17456	100 %	0 %	0 %	0 %	189458518
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201	NC_010813	GAC	2	6	19244	19249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458520
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217	NC_010813	TCCG	2	8	21455	21462	0 %	25 %	25 %	50 %	189458522
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220	NC_010813	TA	3	6	21574	21579	50 %	50 %	0 %	0 %	189458522
221	NC_010813	GTCGCA	2	12	21820	21831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189458523
222	NC_010813	GCAA	2	8	21865	21872	50 %	0 %	25 %	25 %	189458523
223	NC_010813	AGG	2	6	21937	21942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189458523
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242	NC_010813	CG	3	6	22784	22789	0 %	0 %	50 %	50 %	189458525
243	NC_010813	CTG	2	6	22802	22807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458525
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245	NC_010813	CTT	2	6	22872	22877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189458525
246	NC_010813	GCG	3	9	22892	22900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458525
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248	NC_010813	GCA	3	9	22943	22951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189458525
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250	NC_010813	AAGT	2	8	23038	23045	50 %	25 %	25 %	0 %	189458525
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252	NC_010813	CGAAT	2	10	23156	23165	40 %	20 %	20 %	20 %	189458525
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257	NC_010813	CTG	2	6	23317	23322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189458525
258	NC_010813	GCG	2	6	23332	23337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189458525
259	NC_010813	TGT	2	6	23339	23344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189458525
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262	NC_010813	CGGG	2	8	23434	23441	0 %	0 %	75 %	25 %	189458525
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.